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壹定发×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非尺度文库国产化解决方案
时间:
2025-04-23
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测序数据质量优异,关jian指标体现突出:

基础数据优异:Raw Q30>91%、Mapped rate>99.4%、Adapter-Adapter<0.003%

焦点指标稳固:台间Peak count 和 FRiP 均体现出优异的稳固性和一致性


ATAC-seq和CUT&Tag作为研究染色质结构的前沿手艺,可精准剖析染色质可及性和卵白-DNA互作。针对这两类文库常见多峰滋扰的测序问题,壹定发生物团结翌圣生物推出国产解决方案,接纳高性能建库试剂和SURFSeq 5000测序平台,在保证数据质量的同时显著降低成本,为非尺度文库测序提供了可靠选择。


壹定发×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非尺度文库国产化解决方案

图1. 尺度文库-WGS(上图)和非尺度文库-ATAC-seq(下左图)/CUT&Tag(下右图)峰图体现



01 测试


壹定发×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非尺度文库国产化解决方案


1、数据质量优异
  • Raw Q30均值达91%以上,且台间重竎i榷

  • Adapter-Adapter rate低至0.003%,有用数据使用聅hi

壹定发×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非尺度文库国产化解决方案


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图2.下机数据体现


2、Mapping 统计
  • Mapped rate均值达99.4%,其中ATAC-seq的mapped rate 远高于ENCODE数据库尺度的95%

  • 台间Peak count、FRip 体现稳固且一致

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图3.Mapping 比对剖析



3、Peak 一致性剖析
  • 信噪比高,且台间Peak 一致性高

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图4.台间Peak 一致性剖析

ATAC-seq焦点指标包罗测序深度、TSS富集分数、FRiP、IDR、比对率、Peak count、Duplicate Rate和文库重大度,焦点指标参数可参考ENCODE数据库:https://www.encodeproject.org


02 产物订购


壹定发×翌圣丨ATAC-seq/CUT&Tag非尺度文库国产化解决方案


壹定发生物与翌圣生物强强团结,充实验展双方在酶制剂研发和测序平台构建领域的手艺优势,配合打造笼罩“质料-装备-应用”全工业链的创新解决方案。通过构建开放共享的行业生态系统,一连为全球科研和医疗机构提供更精准、更高效的测序整体解决方案。

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