文章梗概
克日，壹定发生物用户 OncoAtlas LLC、俄罗斯科学院科尔佐夫发育生物学研究以是及莫斯科国立谢东诺夫第一医科大学等机构在 Scientific Reports 上揭晓了题为“ Evaluation of blood MSI burden dynamics to trace immune checkpoint inhibitor therapy efficacy through the course of treatment ”的科研效果。gai研究 基于GenoLab M平台对一连液体活检样本举行panel测序 ， 监测血液中微卫星不稳固性的动态转变，以追踪免疫检查点抑制剂治疗在全疗程的治疗效果。
配景先容
结直肠癌（CRC）仍然是全球癌症 殒命谱 中的主要癌种。使用免疫检查点抑制剂 (ICI) 的免疫疗法(IT) 对CRC 治疗已成为一种有前途的治疗手段 。 然而， ICI 仅在微卫星不稳固性（ MSI ）或错配修复缺陷（ dMMR ）阳性的 CRC 中显示出疗效。在 IV 期 CRC 中， MSI 的频率相对较低，仅为 4% ，而 在 I-III 期 中可达 10-20% ，这使得 IT 成为早期 肿瘤 治疗 的首选战略。评估 MSI 和 dMMR 的尺度要领是 PCR 和免疫组化（ IHC ）， 可是 在临床 实践 中， 这两种要领在 MSI/dMMR 检测 中存在一些 局限性 ： 样本质量不 好 可能 导致 假阴性或假阳性效果，以及两种 检测 要领 可能会导致效果的 差异 。 NGS 是一种新兴的要领， 能适配更多的分子标志，可以通太过析循环肿瘤 DNA （ ctDNA ）中的突变换态监测肿瘤。 基于 NGS 的液体活检（ LB ）剖析在评估肿瘤动态转变和监测治疗反映方面具有显著优势 。
本研究通过监测9名已接受 ICI治疗的MSI阳性CRC患者的血液中MSI的动态转变，探索了这些转变与ICI临床疗效之间的关联。其中，通过GenoLab M测序仪完成了肿瘤小panel（Solo-test Atlas Pro) 测序，获知了治疗前的FFPE样本和一连的液体活检样本的MSI信息。
*以下为gai研究效果解读
效果提要
01?突变谱和血液MSI负荷剖析?
在本ci剖析中， 研究人yuan评估了5例患者的FFPE基线样本。其中， 4个样本通过NGS被确定为MSI 阳性（与IHC/PCR的一致性为80% ；与PCR的一致性为 100% ）。在9个LB的基线样本中，7例样本泛起MSI 阳性。在5个可用的肿瘤 - 血浆配对样本中， NGS检测的MSI状态在 80% 的样本中保持一致。
在血液ctDNA监测时代， 算上特殊检测到3个突变 ，突变总数 到达21个，其中12个被分类为驱动突变， 9个为搭客突变。 这些突变都是CRC的经典突变， 如BRAF突变（图 1 ）。
图1 NGS剖析效果
02?血液微卫星不稳固负荷与临床反映的关联?
对于能在LB样本中检测到血液微卫星不稳固（bMSI）负荷的8例患者而言，bMSI负荷的中位数为1.4%（0.01-40%），而可用的FFPE样本中MSI负荷的中位数为29.3%（10-40%）。LB基线样本的bMSI和FFPE样本中检测到的MSI负荷呈正相关（Pearson’s R 0.47）。在LB中视察到的驱动突变的bMSI负荷与最大variant allele frequency (VAF)也呈正相关（Pearson’s R = 0.7）。
9例患者中，2例发生疾病希望或殒命，他们在检测时间点（病例3的W2，病例9的W4），可视察到bMSI和累积VAF的显着zeng加。病例1的bMSI和VAFs在W2和W4时期有所zeng加，在治疗的第154天（F1点）急剧下降至零值，这与临床上视察到的IHC治疗后的部门缓解（PR）一致。只管病例7没有视察到bMSI和驱动突变的VAF镌汰，但患者经放射学和病理学检测后，批注ICI治疗后完全缓解（CR）。在病例5、6、8中，视察到bMSI和VAF都镌汰至零值，这与病理学检测到的IHC治疗后完全缓解（pCR）一致。总体而言，到达CR、PR或稳固病况（SD）的患者，在随访时bMSI肩负已基本检测不到。
图2 患者一连血浆样本中驱动突变的最大VAF和bMSI负荷的动态转变
为了评估ctDNA监测的动态转变与放射反映的相关性，研究人yuan举行了列联表剖析，选择距离1-3个月举行的成对盘算机断层扫描（CT）效果举行剖析，并将CT效果的转变分为5类：“zeng加凌驾20%”、“zeng加不到20%”、“无转变”、“镌汰不到20%”、“镌汰凌驾20%”。对于每对中的第二个CT效果，选择了在-3/+4周内最靠近的ctDNA举行剖析。ctDNA剖析的效果，同样被分为5类：“zeng加凌驾50%”、“zeng加不到50%”、“无转变”、“镌汰不到50%”、“镌汰凌驾50%”。在这里，“无转变”被界说为转变小于20%，或者对于bMSI来说，绝秠uan浠∮0.1。费舍尔准确磨练显示CT和ctDNA效果之间不存在统计学上的显著关联（图3）。
图3 将肿瘤体积的放射学转变与血液中MSI评分和VAFs的转变相关联。若是CT和ctDNA参数的动态转变一致，则在表格的响应单元格中加一分。使用了以下ctDNA参数：bMSI、所有变异的累积VAF、致癌变异的最大VAF、所有致癌变异的累积VAF。
结论
1.? 本研究形貌了bMSI动态转变与抗PD-1免疫疗法反映之间关系的起源数据；
2.? ctDNA剖析能够准确检测bMSI，这与视察到的突变的VAF高度一致；
3.? 只管与VAF剖析差异，bMSI动态转变在所有病例中都与放射学评估效果一致；
4.?研究 效果为 bMSI 作为 MSI 阳性患者 ICI 疗效 展望 的 生物标志物的进一步验证提供了理论依据。
参考文献
Veselovsky E, Lebedeva A, Kuznetsova O, et al. Evaluation of blood MSI burden dynamics to trace immune checkpoint inhibitor therapy efficacy through the course of treatment[J]. Scientific Reports, 2024, 14(1): 23454.